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                  高通量測序

                  高通量測序:

                  動植物基因組測序包括從頭測序和重測序,從頭測序是指對沒有參考基因組序列信息的某個物種,對其不同長度基因組DNA片段及其文庫進行序列測定;重測序是對已知基因組序列物種的個體進行基因組測序,并在此基礎上對個體或群體進行比較基因組學分析。

                  微生物廣泛存在于自然界中,與人類的生產和生活息息相關。微生物生物多樣性豐富,基因組具有相對較小、重復序列較高、易于突變等特點,因此很有必要對微生物進行全基因組測序。目前,全基因組測序成為微生物遺傳進化、疾病預防控制、生物工程技術等方面重要的研究和開發手段。

                  宏基因組測序,能夠解釋微生物群落多樣性、種群結構、進化關系、功能活性及環境之間的相互協作關系,極大地擴展了微生物學研究范圍。目前宏基因組測序可以分為環境微生物多樣性檢測和宏基因組de novo測序。


                  菌群多樣性組成譜測序研究

                  菌群多樣性組成譜測序以細菌/古菌16S rRNA基因可變區、真菌18S rRNA基因可變區或真菌ITS(Internal transcribed spacer)內轉錄間隔區等微生物特征序列(Signature sequence)為靶點,通過檢測序列的變異和數量,反映菌群中各類微生物物種的身份和豐度,從而快速解碼菌群物種分布特征,闡明樣本間多樣性和組成差異,進而發現差異相關物種。

                  功能基因測序研究

                  借助合適的類群特異性引物,可以檢測菌群中特定種類/功能微生物的特征序列,反映菌群中該特定類群微生物的組成結構,從而發現它們的分布特征,闡明樣本間多樣性和組成差異,進而揭示該類群微生物中與差異相關聯的關鍵成員。


                  RNA測序

                  轉錄組學,是一門在整體水平上研究細胞中所有基因轉錄及轉錄調控規律的學科。轉錄組學的研究對象包括mRNA和非編碼RNA等。新一代高通量測序技術可以全面快速地獲得特定細胞或組織在某一個狀態下幾乎所有轉錄本的序列信息和表達信息,從而準確地分析基因表達差異、基因結構變異、篩選分子標記(SNPs或SSR)等生命科學的重要問題。派森諾生物可以為您提供全面的轉錄組測序服務、基于測序數據的專業和個性化的生物信息學分析服務。


                  擴增子/外顯子測序

                   擴增子測序是對特定長度的PCR產物或者捕獲的片段進行測序,分析序列中的變異。擴增子測序能夠根據不同需求,對目標區域進行高覆蓋度的測序,還可以檢測到低頻突變。目前擴增子測序主要包括針對功能基因的測序、靶向序列定向捕獲片段的測序和甲基化片段測序等類型。 

                  外顯子組是一個物種基因組中全部外顯子區域的總和,該區域包含著合成蛋白質所需要的信息,涵蓋了與個體表型相關的大部分的功能性變異。外顯子組測序是以高效捕獲為前提,相對于全基因組測序,外顯子組測序的覆蓋度更深,數據準確性更高。同時基于大量的公共數據庫提供的外顯子數據,能夠結合現有的資源更好地解釋研究成果。


                  單細胞基因組測序

                  單細胞基因組測序是基于單個細胞水平上采取高質量的全基因組擴增與測序相結合的一項新技術,用于揭示細胞群體差異和細胞進化關系。該技術目前主要應用于腫瘤發生機制及胚胎發育研究。由于腫瘤細胞之間具有異質性,采用該項技術不需培養細胞,可最真實的獲得單克隆癌細胞的具體突變來源及精準的突變頻率,以及區分癌癥發生、發展、演化過程中的主動與被動突變等。


                  三代測序

                  PacBio第三代測序技術引領基因測序新篇章

                  以美國Pacific Biosciences公司為代表的最新的第三代測序技術,相比第二代高通量測序技術,采用了更為先進的SMRT(Single molecule real-time)單分子實時測序技術,從而避開了第二代測序技術中依賴于PCR擴增起始DNA片段的步驟(用于放大堿基熒光信號)。PacBio專利的SMRT技術的誕生賦予了第三代測序技術全面的優勢:

                  1. 不依賴于PCR擴增富集待測DNA片段:真正實現了對起始DNA分子的測定,避免了PCR擴增過程中出現的偏差、錯誤和嵌合體;

                  2. 測序讀長輕松達到10 kb甚至更長:相比第二代測序技術取得質的飛躍,極大地提升了物種鑒定的精度和靈敏度,大幅度改進了全基因組序列圖譜的拼接組裝和繪制能力;

                  3. 獨有的CCS環形一致性測序模式(Circular-consensus sequence):不存在系統性的檢測偏差,堿基讀取錯誤分布隨機,因而能夠對每個待測DNA分子進行循環測序,從而獲得準確率極高的一致性序列(多次循環后的一致性準確率可達99.999%以上),也有利于進行單倍體型鑒定、基因組罕見突變和SNP單核苷酸多態性(Single nucleotide polymorphism)等驗證;

                  4. DNA聚合酶系統強大:對于A/T和G/C堿基的檢測無偏好性,可均勻覆蓋全基因組,輕松測定高GC含量和Poly-A序列區域等第二代測序技術難以解決的技術瓶頸;

                  5. 能夠直接原位檢測堿基修飾:如DNA甲基化檢測等。

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